Учёные из Калифорнийского технологического института (Caltech) разработали метод сборки ДНК под названием Sidewinder. Он позволяет собирать десятки генетических последовательностей одновременно в одной пробирке. Точность — одна ошибка на 10 миллионов соединений. Обычные методы ошибаются раз на 10–30 сборок. «Это скачок», — говорит Томас Гороховский, биоинженер из Бристольского университета. По его словам, технология открывает путь к синтезу крупных генетических систем и даже маленьких геномов, что критически важно для генеративного ИИ в биологии.
Sidewinder представили на SynBioBeta 2026 в Сан-Хосе, Калифорния. Препринт опубликован на bioRxiv. Метод решает ключевую проблему: генеративные ИИ-инструменты вроде Evo 2 проектируют новые последовательности ДНК с огромной скоростью, но физическое создание этих последовательностей в лаборатории остаётся медленным и дорогим. Команда под руководством синтетического биолога Кайханга Ванга продемонстрировала, как работает метод. Они использовали Evo 2, чтобы перепроектировать участок генома E. coli длиной в 12 500 букв, а затем собрали его с помощью Sidewinder без единой ошибки. Брайан Хи, вычислительный биолог из Стэнфорда и создатель Evo 2, подсчитал: коммерческими методами на такой проект ушёл бы месяц. С Sidewinder — несколько дней.
Как это работает? Обычную сборку ДНК сравнивают с подбором рукописи без номеров страниц: приходится подгонять конец одной страницы к началу другой. Пока страниц мало — работает. Как только последовательности начинают повторяться — хаос. Sidewinder использует молекулярные штрихкоды — короткие последовательности, которые метят каждый фрагмент. Они работают как номера страниц: каждый кусочек ДНК соединяется только с тем соседом, который нужен. Штрихкоды образуют временный тройной узел, который потом удаляется, оставляя чистую цепочку.
Раньше расчёт этих штрихкодов требовал огромных вычислительных мощностей и тормозил при масштабировании. Бывший студент Caltech Жан-Себастьен Поль написал инструмент PyWinder — он рассчитывает штрихкоды за минуты на обычном ноутбуке. Постдок Ной Робинсон адаптировал метод к дешёвым массовым компонентам ДНК, что дополнительно снизило стоимость.
Ван, Робинсон, Хи и предприниматель Адриан Вулфсон основали компанию Genyro для коммерциализации технологии. Они планируют зарабатывать на фармацевтических и биотех-клиентах, но обещают сделать Sidewinder доступным для академических лабораторий. «Мы хотим, чтобы люди делали с этой технологией крутые вещи», — говорит Робинсон.